Посттранскрипциона модификација
Посттранскрипциона модификација или котранскрипциона модификација је процес у еукариотским ћелијама у коме се примарни транскрипт РНК конвертује у зрелу РНК. Значајан пример је конверзија прекурзорске информационе РНК у крајњу информациону РНК (иРНК) која се формира пре транслације протеина. Процес обухвата три главна корака: адиција 5' капе, адиција 3' поли-аденилационог репа, и сплајсовање. Овај процес је виталан за коректну транслацију генома еукариота, зато што иницијална прекурзорска иРНК која се формира током транскрипције садржи ексоне (кодирајућие или важне секвенце које учествују у транслацији), и интроне (некодирајуће секвенце).[1]
Базе података
уреди| Име | Опис | Тип | Линк | Референце |
|---|---|---|---|---|
| РМБасе | RMBase је дизајнирана за декодирање простора РНК модификација идентификованог на бази секвенцирања високог капацитета (Pseudo-seq, Ψ-seq, CeU-seq, Aza-IP, MeRIP-seq, m6A-seq, miCLIP, m6A-CLIP, RiboMeth-seq). У овом извору су демонстриране хиљаде РНК модификација лоцираних на иРНК, регулаторним нцРНК (е.г. lncRNA, miRNA), места везивања miRNA и SNP мутације вазане за болести. | база података | вебсајт[мртва веза] | [2] |
| MODOMICS | MODOMICS је база података РНК модификација која пружа свеобухватне информације о хемијским структурама модификованих рибонуклеозида, ниховим биосинтетичким путевима, ензимима који модификују РНК и локацијама модификованих остатака у РНК секвенцама. | база података | вебсајт | [3] |
| RNAMDB | RNAMDB служи као фокална тачка за информације везане за природне РНК модификације | база података | вебсајт | [4] |
| . | ||||
Види још
уредиРеференце
уреди- ^ Берг, Тyмоцзко & Стрyер 2007, стр. 836
- ^ Сун, WЈ; Ли, ЈХ; Лиу, С; Wу, Ј; Зхоу, Х; Qу, ЛХ; Yанг, ЈХ (11. 10. 2015). „РМБасе: а ресоурце фор децодинг тхе ландсцапе оф РНА модифицатионс фром хигх-тхроугхпут сеqуенцинг дата.”. Нуцлеиц Ацидс Ресеарцх. 44: гкв1036. ПМЦ 4702777
. ПМИД 26464443. дои:10.1093/нар/гкв1036.
- ^ Мацхницка, МА; Миланоwска, К; Осман Оглоу, О; Пурта, Е; Куркоwска, M; Олцхоwик, А; Јанусзеwски, W; Калиноwски, С; Дунин-Хоркаwицз, С; Ротхер, КМ; Хелм, M; Бујницки, ЈМ; Гросјеан, Х (децембар 2012). „МОДОМИЦС: а датабасе оф РНА модифицатион патхwаyс--2013 упдате.”. Нуцлеиц Ацидс Ресеарцх. 41 (Датабасе иссуе): Д262—7. ПМЦ 3531130 . ПМИД 23118484. дои:10.1093/нар/гкс1007.
- ^ Цантара, WА; Цраин, ПФ; Розенски, Ј; МцЦлоскеy, ЈА; Харрис, КА; Зханг, X; Вендеиx, ФА; Фабрис, D; Агрис, ПФ (децембар 2010). „Тхе РНА Модифицатион Датабасе, РНАМДБ: 2011 упдате.”. Нуцлеиц Ацидс Ресеарцх. 39 (Датабасе иссуе): Д195—201. ПМЦ 3013656 . ПМИД 21071406. дои:10.1093/нар/гкq1028.
Литература
уреди- Берг, Јеремy M.; Тyмоцзко, Јохн L.; Стрyер, Луберт (2007), Биоцхемистрy (6 изд.), Неw Yорк: WХ Фрееман & Цо., ИСБН 978-0-7167-6766-4
- Хамес, Давид; Хоопер, Нигел (2006), Инстант Нотес Биоцхемистрy (3 изд.), Леедс: Таyлор анд Францис, ИСБН 978-0-415-36778-3
Спољашње везе
уредиРМБасе РНА Модифицатион Басе ис десигнед фор децодинг тхе ландсцапе оф РНА модифицатионс идентифиед фром хигх-тхроугхпут сеqуенцинг дата (Псеудо-сеq, Ψ-сеq, ЦеУ-сеq, Аза-ИП, МеРИП-сеq, м6А-сеq, миЦЛИП, м6А-ЦЛИП, РибоМетх-сеq).
- Пост-Трансцриптионал+РНА+Модифицатион на US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)