Cisteinska peptidaza
Cisteinske proteaze – poznate i kao tiolske proteaze – su enzimi koji degradiraju proteine. Ove proteaze imaju zajedničke katalitičke mehanizme koji uključuju nukleofilni cisteinski tiol u katalitičkoj trijadi ili dijadi.
| Cisteinska peptidaza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Kristalna struktura cisteinske peptidaze papainskog kompleksa sa kovalentnim inhibitorom E-64. | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
| Simbol | Peptidase_C1 | ||||||||
| Pfam | PF00112 | ||||||||
| Pfam klan | CL0125 | ||||||||
| InterPro | IPR000668 | ||||||||
| SMART | SM00645 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00126 | ||||||||
| MEROPS | C1 | ||||||||
| SCOP | 1aec | ||||||||
| SUPERFAMILY | 1aec | ||||||||
| OPM superfamilija | 420 | ||||||||
| OPM protein | 1m6d | ||||||||
| |||||||||
Cisteinske proteaze su generalno nalaze u voću, uključujući papaju, ananas smokvu i kivi. Proporcija proteaza je veća u nezrelom voću. U stvari, poznato je nekoliko porodica čiji predstavnici sadrže cisteinske proteaze.[1] Cisteinske proteaze se upotrebljavaju kao ingredijenti – sastojci za učvršćivanje mesa.[2][3][4][5][6]
Klasifikacija
уредиMEROPS sistem klasifikacije proteaza uračunava 14 proteinskih superfamilija plus nekoliko neoznačenih (do 2013), a svaka sadrži mnogo familija. Svaka superporodica ima katalitičku trijadu ili dijadu u različitim proteinskim naborima i tako ukazuju na konvergentnu evoluciju katalitičkog mehanizma.
Za proteinske superfamilije, P = superfamilija koja sadrži mešavinu nukleofilnih klasa familija, C = čista cisteinska proteazna superfamilija. U svakoj superfamiliji, proteinske familije su označene karakterističnim nukleofilom (C = cisteinske proteaze).
Familije cisteinskih proteaza
Reference
уреди- ^ Domsalla A, Melzig MF (2008). „Occurrence and properties of proteases in plant latices”. Planta Med. 74 (7): 699—711. PMID 18496785. doi:10.1055/s-2008-1074530.
- ^ Bajrović K, Jevrić-Čaušević A., Hadžiselimović R., Ed. (2005): Uvod u genetičko inženjerstvo i biotehnologiju. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, ISBN 978-9958-9344-1-4.
- ^ Ibrulj S., Haverić S., Haverić A. (2008): Citogenetičke metode – Primjena u medicini . Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo,ISBN 978-9958-9344-5-2.
- ^ Hadžiselimović R., Pojskić N. (2005): Uvod u humanu imunogenetiku. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, ISBN 978-9958-9344-3-8.
- ^ Sofradžija A., Šoljan D., Hadžiselimović R. (2000): Biologija 1, Svjetlost, Sarajevo
- ^ Međedović S., Maslić E., Hadžiselimović R. (2000): Biologija 2. Svjetlost, Sarajevo, ISBN 978-9958-10-222-6.
- ^ Mitchel, R. E.; Chaiken, I. M.; Smith, E. L. (1970). „The complete amino acid sequence of papain. Additions and corrections”. The Journal of Biological Chemistry. 245 (14): 3485—92. PMID 5470818.
- ^ Sierocka, I; Kozlowski, L. P.; Bujnicki, J. M.; Jarmolowski, A; Szweykowska-Kulinska, Z (2014). „Female-specific gene expression in dioecious liverwort Pellia endiviifolia is developmentally regulated and connected to archegonia production”. BMC Plant Biology. 14: 168. PMC 4074843
. PMID 24939387. doi:10.1186/1471-2229-14-168.
- ^ Sorimachi, H; Ohmi, S; Emori, Y; Kawasaki, H; Saido, T. C.; Ohno, S; Minami, Y; Suzuki, K (1990). „A novel member of the calcium-dependent cysteine protease family”. Biological chemistry Hoppe-Seyler. 371 Suppl: 171—6. PMID 2400579.
Spoljašnje veze
уреди
- The MEROPS online database for peptidases and their inhibitors: Cysteine Peptidases Архивирано на сајту Wayback Machine (4. април 2017)
- Cysteine+endopeptidases на US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
